这种时候，在蒙古喀尔喀右翼地区，做为宗主的札萨克图汗一族，与分家族人之间发生了内乱。札萨克图汗一族的领地，是杭爱山脉北部、色愣格河溪谷的肥沃土壤地带。相对地，分家的阿勒坦汗一族领地，则是丛杭爱山脉至阿尔泰山脉一带，君临瓦刺各个部族之上。与康熙皇帝同时代的阿勒坦汗是额磷沁・罗卜藏・珲台吉，据说是位气宇轩昂、贤能的领导者。此时，因为左翼与清廷距离邻近，受惠于中国贸易而日益繁盛；反之，额磷沁・罗卜藏・珲台吉自己所属的右翼，相段之下距离中国较远，因此逐渐被这种不利的状态中，这让他不禁感到忧心忡忡。
最后，额磷沁打算进军北蒙古的中央地带；一六六二年，他入侵位于路线上的宗主——札萨克图汗之领地，杀害当时在位的旺舒克・墨尔根汗。面对这埸危机，左翼立即做出回应，察珲多尔济赶往札萨克留汗领地救援，击溃额磷沁的军队。额磷沁逃往位于今日俄罗斯聊邦图瓦共和国的叶尼塞河上游溪谷。札萨克图汗宗族的领袖遭到杀害，内部陷入一片混乱,旺舒克的兄长绰-墨尔根登上汗位，却无实权，大部分的人民都去追随占领当地的察珲多尔济土谢图汗了。
另一方面，过去向额磷沁奉为领袖的瓦剌各部族，眼见额磷沁犯下诛杀宗主的罪行，纷纷决定转向，与土谢图汗家族合作。一六六七年，准噶尔的僧格远征，将额磷沁捉回，砍下额磷沁右手的手掌，再把狗肉塞进他的喉咙后，交给札萨克图汗的族人。三年后，纪・墨尔根・札萨克汗因权势薄弱被迫退位，弟弟成衰登上札萨克图汗的宝座。毋庸置言，在这背后当然是有着察珲多尔济汗的意志操作。对察珲多尔济而言，费心心力才取得的右翼统治权，常然不可能轻易放手。
正好在此时，准噶尔部的僧格被杀害身亡，噶尔丹登上部族首领之位。眼见过去的宗主札萨克图汗对旁系的察珲多尔济呈现言听计的现状，噶尔丹相当不悦，于是在背后推了成袞一把，纪成袞当着察珲多尔济的面，要求归还在额磷沁之乱时,从札萨克图汗宗族转向投靠土谢图汗家族的旧有族人。
另一方面，噶尔丹也联系拉萨的格鲁派本部，请本部以达赖喇嘛五世的名义派遣使者出面,负责调停察珲多尔济和成袞之间的冲突。但察珲多尔济不接受达赖的调停，最后谈判以破裂告终；于是，一边是代表喀乐喀左翼的察珲多尔济,一边是代表喀尔喀右翼的成袞以及在后方支持成袞的噶尔丹，两方的对立关系更为恶化。
至于清朝的康熙皇帝，既对喀尔喀左翼抱持着亲近感，又对察珲多尔济的立埸感到同情；但是另一方面康熙皇帝也忧心，倘若放任喀尔喀左、右翼的纷争发展下去，混乱将会波及南蒙古，丛而对大清帝国的北方国境安全造成威协。因此，康熙皇帝联络拉萨的格鲁派本部，共同出面策划调停。一六八六年，在康熙皇帝的代理人——理藩院尚书阿喇尼的见证之下，于杭爱山南面的拜德拉格河溪谷，一处名为枯冷白尔齐尔之地，召开和谈会议。此时碰巧成袞逝世，右翼方面是由成袞之子沙喇继承父亲的札萨克图汗位出席会议，并且由拉萨甘丹寺的座主，以达赖喇嘛五世的代理人身分陪同出席。至于左翼方面，则是由察珲多尔济汗以及弟弟哲布尊丹巴一世出面。根据这埸和谈会议所订下的和约，察珲多尔济同意归还札萨克图汗宗族的旧有人民。
然而，在这埸枯冷白尔齐尔和谈会议上，哲布尊丹巴与达赖喇嘛的代理人甘丹寺座主坐在同等高度的位置,并且在所有方面的举动都展现出对等的立埸。虽然这似乎不是基于康熙皇帝的指令，但哲布尊丹巴的态度惹怒了噶尔丹。正如前文所述，哲布尊丹巴是在尹咱・呼图克图三世之下受戒，而噶尔丹正是尹咱・呼国克国三世的转世。以噶尔丹的角度看来，哲布尊丹巴不过就是自己前世的弟子身分，竟然打算和自己景仰、师事的达赖喇嘛五世代理人平起平坐。这件事看在噶尔丹的眼里，已经到达忍无可忍的程度。
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